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陈新滋院士在均相氢化不对称合成反应历程研究中发现了新的机理，得到国际广泛援用。研究开发了手性药物萘普森的不对称合成的可行方法，被认为是1991年国际化学方面的重要进展。在手性催化配体和催化剂的研究中发现了螺环氧膦配体、胺膦配体、联吡啶膦配体等高性能的配体和催化剂，获得多项中国和美国专利，同时致力于新药及新颖制药技术的研究与开发。
陈新滋院士认识到在原创新药方面，我们国家和国际前沿存在相当大的差距，提出“原创新药开发对我们国家迫在眉睫”的观点，所负责的“岭南中草药活性化合物库的构建及重大疾病候选药物发现”项目取得广东省重点领域研发计划立项。他带领团队研发的基于原癌基因C-Met靶点的抗癌新药候选化合物已进入临床前研究，有望成为下一代抗癌新药。
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